Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUSC1Q9BVN2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUSC1Q9BVN2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms