Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RSRP1Q9BUV0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RSRP1Q9BUV0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSRP1Q9BUV0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSRP1Q9BUV0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSRP1Q9BUV0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSRP1Q9BUV0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSRP1Q9BUV0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSRP1Q9BUV0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSRP1Q9BUV0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSRP1Q9BUV0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSRP1Q9BUV0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSRP1Q9BUV0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RSRP1Q9BUV0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RSRP1Q9BUV0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RSRP1Q9BUV0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RSRP1Q9BUV0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms