Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUE0

MED18, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED18Q9BUE0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED18Q9BUE0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED18Q9BUE0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED18Q9BUE0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED18Q9BUE0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED18Q9BUE0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED18Q9BUE0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED18Q9BUE0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED18Q9BUE0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MED18Q9BUE0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED18Q9BUE0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MED18Q9BUE0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MED18Q9BUE0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MED18Q9BUE0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MED18Q9BUE0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED18Q9BUE0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED18Q9BUE0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED18Q9BUE0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED18Q9BUE0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED18Q9BUE0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms