Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMEM208Q9BTX3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMEM208Q9BTX3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms