Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CRACR2AQ9BSW2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRACR2AQ9BSW2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRACR2AQ9BSW2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms