Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDF4Q9BRK5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SDF4Q9BRK5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SDF4Q9BRK5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms