Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CPPED1Q9BRF8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CPPED1Q9BRF8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms