Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC77Q9BR77 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC77Q9BR77 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms