Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ61

C19orf43, Uncharacterized protein C19orf43, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf43Q9BQ61 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf43Q9BQ61 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf43Q9BQ61 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf43Q9BQ61 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf43Q9BQ61 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf43Q9BQ61 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf43Q9BQ61 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf43Q9BQ61 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf43Q9BQ61 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf43Q9BQ61 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf43Q9BQ61 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C19orf43Q9BQ61 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C19orf43Q9BQ61 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C19orf43Q9BQ61 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms