Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VGLL1Q99990 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VGLL1Q99990 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms