Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PKP2Q99959 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PKP2Q99959 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKP2Q99959 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms