Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BARD1Q99728 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BARD1Q99728 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BARD1Q99728 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms