Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POP1Q99575 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POP1Q99575 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POP1Q99575 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POP1Q99575 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POP1Q99575 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POP1Q99575 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POP1Q99575 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POP1Q99575 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POP1Q99575 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POP1Q99575 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POP1Q99575 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
POP1Q99575 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
POP1Q99575 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POP1Q99575 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POP1Q99575 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POP1Q99575 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POP1Q99575 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POP1Q99575 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POP1Q99575 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POP1Q99575 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
POP1Q99575 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POP1Q99575 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
POP1Q99575 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POP1Q99575 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POP1Q99575 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POP1Q99575 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POP1Q99575 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POP1Q99575 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POP1Q99575 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POP1Q99575 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POP1Q99575 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POP1Q99575 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POP1Q99575 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POP1Q99575 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POP1Q99575 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POP1Q99575 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POP1Q99575 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POP1Q99575 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
POP1Q99575 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POP1Q99575 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POP1Q99575 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POP1Q99575 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POP1Q99575 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POP1Q99575 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POP1Q99575 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POP1Q99575 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POP1Q99575 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POP1Q99575 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POP1Q99575 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POP1Q99575 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POP1Q99575 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POP1Q99575 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POP1Q99575 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POP1Q99575 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POP1Q99575 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
POP1Q99575 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POP1Q99575 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POP1Q99575 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POP1Q99575 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POP1Q99575 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POP1Q99575 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POP1Q99575 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POP1Q99575 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POP1Q99575 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POP1Q99575 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POP1Q99575 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POP1Q99575 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POP1Q99575 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POP1Q99575 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POP1Q99575 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POP1Q99575 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POP1Q99575 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POP1Q99575 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POP1Q99575 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POP1Q99575 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POP1Q99575 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POP1Q99575 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POP1Q99575 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POP1Q99575 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POP1Q99575 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POP1Q99575 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POP1Q99575 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POP1Q99575 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POP1Q99575 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POP1Q99575 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POP1Q99575 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POP1Q99575 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POP1Q99575 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POP1Q99575 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POP1Q99575 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POP1Q99575 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POP1Q99575 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POP1Q99575 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POP1Q99575 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POP1Q99575 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POP1Q99575 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POP1Q99575 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POP1Q99575 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POP1Q99575 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms