Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNN2Q99439 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNN2Q99439 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms