Protein–RNA interactions for Protein: Q96S96

PEBP4, Phosphatidylethanolamine-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEBP4Q96S96 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PEBP4Q96S96 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PEBP4Q96S96 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEBP4Q96S96 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEBP4Q96S96 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEBP4Q96S96 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEBP4Q96S96 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PEBP4Q96S96 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms