Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC114Q96M63 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC114Q96M63 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC114Q96M63 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms