Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
C9orf72Q96LT7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf72Q96LT7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms