Protein–RNA interactions for Protein: Q96KQ4

PPP1R13B, Apoptosis-stimulating of p53 protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R13BQ96KQ4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R13BQ96KQ4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R13BQ96KQ4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R13BQ96KQ4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R13BQ96KQ4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R13BQ96KQ4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R13BQ96KQ4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP1R13BQ96KQ4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R13BQ96KQ4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R13BQ96KQ4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R13BQ96KQ4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R13BQ96KQ4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R13BQ96KQ4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R13BQ96KQ4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R13BQ96KQ4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R13BQ96KQ4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R13BQ96KQ4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R13BQ96KQ4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R13BQ96KQ4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP1R13BQ96KQ4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPP1R13BQ96KQ4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R13BQ96KQ4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms