Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCPIP1Q96JH7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VCPIP1Q96JH7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VCPIP1Q96JH7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms