Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEC22AQ96IW7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SEC22AQ96IW7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms