Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IMP4Q96G21 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IMP4Q96G21 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IMP4Q96G21 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms