Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIPA1Q96FS4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SIPA1Q96FS4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SIPA1Q96FS4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms