Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINGO1Q96FE5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LINGO1Q96FE5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINGO1Q96FE5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms