Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL29Q96CT2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLHL29Q96CT2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLHL29Q96CT2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms