Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ULK4Q96C45 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ULK4Q96C45 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.5 ms