Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXOSC8Q96B26 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXOSC8Q96B26 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EXOSC8Q96B26 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms