Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SNX21Q969T3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SNX21Q969T3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNX21Q969T3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNX21Q969T3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNX21Q969T3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SNX21Q969T3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNX21Q969T3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNX21Q969T3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SNX21Q969T3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNX21Q969T3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SNX21Q969T3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SNX21Q969T3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SNX21Q969T3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SNX21Q969T3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNX21Q969T3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SNX21Q969T3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SNX21Q969T3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SNX21Q969T3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SNX21Q969T3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SNX21Q969T3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX21Q969T3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms