Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF34Q969K3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF34Q969K3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF34Q969K3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms