Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC38A4Q969I6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC38A4Q969I6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms