Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HPS3Q969F9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HPS3Q969F9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HPS3Q969F9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms