Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NKD2Q969F2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKD2Q969F2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms