Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXT2Q93063 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXT2Q93063 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXT2Q93063 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXT2Q93063 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXT2Q93063 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXT2Q93063 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXT2Q93063 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXT2Q93063 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXT2Q93063 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXT2Q93063 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXT2Q93063 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXT2Q93063 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXT2Q93063 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EXT2Q93063 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXT2Q93063 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms