Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RUBCNQ92622 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RUBCNQ92622 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RUBCNQ92622 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms