Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GIPC3Q8TF64 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GIPC3Q8TF64 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GIPC3Q8TF64 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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