Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R17PQ8TDU5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VN1R17PQ8TDU5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VN1R17PQ8TDU5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms