Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGR3Q8TD06 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGR3Q8TD06 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGR3Q8TD06 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGR3Q8TD06 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGR3Q8TD06 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGR3Q8TD06 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGR3Q8TD06 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGR3Q8TD06 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGR3Q8TD06 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGR3Q8TD06 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGR3Q8TD06 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AGR3Q8TD06 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGR3Q8TD06 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGR3Q8TD06 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGR3Q8TD06 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGR3Q8TD06 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGR3Q8TD06 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms