Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACVR1CQ8NER5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVR1CQ8NER5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVR1CQ8NER5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVR1CQ8NER5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVR1CQ8NER5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVR1CQ8NER5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVR1CQ8NER5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVR1CQ8NER5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVR1CQ8NER5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACVR1CQ8NER5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACVR1CQ8NER5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACVR1CQ8NER5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACVR1CQ8NER5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms