Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIBP2Q8ND30 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP2Q8ND30 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP2Q8ND30 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP2Q8ND30 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP2Q8ND30 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP2Q8ND30 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP2Q8ND30 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP2Q8ND30 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP2Q8ND30 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP2Q8ND30 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPFIBP2Q8ND30 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms