Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RDH13Q8NBN7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RDH13Q8NBN7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RDH13Q8NBN7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms