Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMEM87AQ8NBN3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TMEM87AQ8NBN3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TMEM87AQ8NBN3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms