Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M0

OTUD6B, OTU domain-containing protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6BQ8N6M0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD6BQ8N6M0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
OTUD6BQ8N6M0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD6BQ8N6M0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms