Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHCHD4Q8N4Q1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHCHD4Q8N4Q1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHCHD4Q8N4Q1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms