Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFRP1Q8N474 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SFRP1Q8N474 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SFRP1Q8N474 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms