Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC8AQ8IWT6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC8AQ8IWT6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms