Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PPFIBP1Q86W92 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPFIBP1Q86W92 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms