Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5S9

TMEM144, Transmembrane protein 144, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM144Q7Z5S9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM144Q7Z5S9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM144Q7Z5S9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM144Q7Z5S9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM144Q7Z5S9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms