Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX6Q7RTT6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX6Q7RTT6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX6Q7RTT6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX6Q7RTT6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX6Q7RTT6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX6Q7RTT6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX6Q7RTT6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX6Q7RTT6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSX6Q7RTT6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX6Q7RTT6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX6Q7RTT6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX6Q7RTT6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX6Q7RTT6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX6Q7RTT6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSX6Q7RTT6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX6Q7RTT6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX6Q7RTT6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSX6Q7RTT6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SSX6Q7RTT6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SSX6Q7RTT6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms