Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NLRC3Q7RTR2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NLRC3Q7RTR2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms