Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDZD4Q76G19 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDZD4Q76G19 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDZD4Q76G19 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms