Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC129Q6ZRS4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC129Q6ZRS4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC129Q6ZRS4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms